医院被定位于特定功能的医院。直到2013年的现在，除了作为大学附属医院以外，同时被认可为特定功能医院的有本院和国立循环器官疾病研究中心医院，国立癌研究中心中央医院，癌研究会有明医院，国立国际医疗研究中心医院，静冈县立静冈癌中心。